Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP1O00294 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP1O00294 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP1O00294 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP1O00294 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP1O00294 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP1O00294 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms