Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
J3KT08 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
J3KT08 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
J3KT08 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
J3KT08 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
J3KT08 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
J3KT08 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3KT08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms