Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
I3L3M4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
I3L3M4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
I3L3M4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
I3L3M4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
I3L3M4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
I3L3M4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
I3L3M4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms