Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
H7C1H1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H7C1H1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H7C1H1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H7C1H1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H7C1H1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H7C1H1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H7C1H1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms