Protein–RNA interactions for Protein: H3BRJ5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BRJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BRJ5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BRJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BRJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BRJ5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BRJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BRJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BRJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BRJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BRJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BRJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms