Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
E9PMD0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
E9PMD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
E9PMD0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E9PMD0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E9PMD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
E9PMD0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
E9PMD0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
E9PMD0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PMD0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PMD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PMD0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PMD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms