Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ERVV-2B6SEH9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ERVV-2B6SEH9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ERVV-2B6SEH9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms