Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HMGB1P1B2RPK0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HMGB1P1B2RPK0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms