Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00587B1AMM8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00587B1AMM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms