Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RGPD3A6NKT7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RGPD3A6NKT7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms