Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CD8B2A6NJW9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CD8B2A6NJW9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms