Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HMX3A6NHT5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HMX3A6NHT5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms