Protein–RNA interactions for Protein: A6NH11

GLTPD2, Glycolipid transfer protein domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLTPD2A6NH11 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLTPD2A6NH11 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLTPD2A6NH11 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLTPD2A6NH11 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms