Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC01546A6NGU7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC01546A6NGU7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms