Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PALM3A6NDB9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PALM3A6NDB9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms