Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC055717.2-201ENST00000561864 577 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC100793.3-201ENST00000592440 719 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TTLL2-201ENST00000239587 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC019294.1-202ENST00000566174 2071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ACO1-202ENST00000379923 3601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL3-205ENST00000567476 6873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF483-203ENST00000358151 2433 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BCL2L13-213ENST00000538149 4797 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FMO6P-202ENST00000367754 2130 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ITGBL1-205ENST00000545560 4808 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 INVS-202ENST00000262457 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CATSPERG-202ENST00000409235 3746 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF552-201ENST00000391701 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRMT12-201ENST00000328599 2207 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC139099.1-202ENST00000574098 2409 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 GRK1-201ENST00000335678 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PPP2R1B-202ENST00000341980 1953 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC122129.1-201ENST00000354746 1815 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SLC8A3-201ENST00000216568 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TKTL1-202ENST00000369915 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 NRAP-203ENST00000369358 5534 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 BCL11A-202ENST00000356842 3959 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 ITGAX-203ENST00000562522 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 LILRA1-202ENST00000453777 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 AC006372.3-201ENST00000444158 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 MPP2-220ENST00000622681 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 SMG7-212ENST00000507469 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SMIM3Q9BZL3 CYLD-214ENST00000569418 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SMIM3Q9BZL3 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SMIM3Q9BZL3 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SMIM3Q9BZL3 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SMIM3Q9BZL3 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SMIM3Q9BZL3 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SMIM3Q9BZL3 GRM3-203ENST00000439827 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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