Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRJQ12913 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 RABL2A-207ENST00000409875 2282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 PSG9-201ENST00000244293 2073 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 MASP2-201ENST00000400897 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRJQ12913 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PTPRJQ12913 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PTPRJQ12913 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PTPRJQ12913 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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PTPRJQ12913 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PTPRJQ12913 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 CA6-203ENST00000377443 1319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PTPRJQ12913 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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