Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OR10N1P-203ENST00000641736 1305 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CREB5-204ENST00000396300 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PCDHGA2-202ENST00000528330 4543 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SPO11-201ENST00000345868 1666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FRMD6-204ENST00000553556 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LIF-201ENST00000249075 3969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RGS3-207ENST00000374140 4591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NICN1Q9BSH3 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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