Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ACVR1C-202ENST00000335450 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AL133464.1-205ENST00000634595 1535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 C6orf163-203ENST00000608326 2110 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 CHST4-202ENST00000539698 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 PSORS1C2-201ENST00000259845 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ZNF226-212ENST00000588795 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 CETP-202ENST00000379780 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ABCB4-201ENST00000265723 4020 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AL157838.1-201ENST00000424252 2502 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 SERPINA1-220ENST00000636712 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRJQ12913 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms