Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL4A3BPQ9Y5P4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL4A3BPQ9Y5P4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms