Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPO11Q9Y5K1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPO11Q9Y5K1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPO11Q9Y5K1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPO11Q9Y5K1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPO11Q9Y5K1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPO11Q9Y5K1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPO11Q9Y5K1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms