Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB12Q9Y5F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB12Q9Y5F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB12Q9Y5F1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCDHB12Q9Y5F1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCDHB12Q9Y5F1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms