Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB4Q9Y5E5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB4Q9Y5E5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms