Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED16Q9Y2X0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED16Q9Y2X0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED16Q9Y2X0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms