Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1DQ9Y2S0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
POLR1DQ9Y2S0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms