Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G3

ATP11B, Probable phospholipid-transporting ATPase IF, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11BQ9Y2G3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP11BQ9Y2G3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP11BQ9Y2G3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP11BQ9Y2G3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms