Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1Q9Y2A7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1Q9Y2A7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1Q9Y2A7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms