Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC4Q9Y296 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC4Q9Y296 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms