Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NUDCQ9Y266 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NUDCQ9Y266 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUDCQ9Y266 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms