Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVW-1Q9UQF0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVW-1Q9UQF0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms