Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLEC4EQ9ULY5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLEC4EQ9ULY5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms