Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CIZ1Q9ULV3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIZ1Q9ULV3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms