Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MED23Q9ULK4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MED23Q9ULK4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms