Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

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Length 1,477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NRXN1Q9ULB1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NRXN1Q9ULB1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NRXN1Q9ULB1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
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