Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP21Q9UK80 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP21Q9UK80 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP21Q9UK80 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms