Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH22Q9UJ99 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH22Q9UJ99 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH22Q9UJ99 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms