Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MBD1Q9UIS9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MBD1Q9UIS9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms