Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SCOCQ9UIL1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCOCQ9UIL1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.3 ms