Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CTNNA3Q9UI47 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNNA3Q9UI47 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms