Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PUF60Q9UHX1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PUF60Q9UHX1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms