Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFF4Q9UHB7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AFF4Q9UHB7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AFF4Q9UHB7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AFF4Q9UHB7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms