Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NIPSNAP3AQ9UFN0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPSNAP3AQ9UFN0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms