Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CFDP1Q9UEE9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFDP1Q9UEE9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFDP1Q9UEE9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms