Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APEX2Q9UBZ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APEX2Q9UBZ4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms