Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EXTL2Q9UBQ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EXTL2Q9UBQ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms