Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EIF3KQ9UBQ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EIF3KQ9UBQ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms