Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC6Q9UBN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC6Q9UBN7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms