Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MGAT4CQ9UBM8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MGAT4CQ9UBM8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms