Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC88CQ9P219 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC88CQ9P219 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms