Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NLGN3Q9NZ94 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NLGN3Q9NZ94 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms